昌都寺与内地王朝的关系历来极为密切。从清朝康熙帝开始，该寺主要活佛受历代皇帝的册封。寺内至今保存有康熙58年5月颁发给帕巴拉活佛的铜印。乾隆56年，乾隆帝为昌都寺书赠“祝厘寺”的匾额。昌都强巴林寺有五大活佛世系，十二个扎仓，僧人最多时达5000余人，并辖周围小寺70座。现任全国人大副委员长帕巴拉·格列朗杰为该寺第一大活佛，现已转世至11世。
　 　该寺主要建筑保存完好，经堂内塑有数以百计的各类佛像和高僧塑像，上千平方米的壁画以及众多的唐卡画，可以说是汇集了昌都能工巧匠的聪明才智，代表了昌都一带最高水平。

 
　 　强巴林寺的“古庆”跳神素以狰狞逼真的面具，整齐典雅的动作造型，宏大的场面而闻名雪域高原。该寺跳的铖斧舞，服饰整齐华丽，舞姿古朴典雅，配器简约清越。以该寺独有的宗教舞蹈为形式的昌都藏戏在整个西藏自成一派。该寺喇嘛跳的“卓”舞更是一绝。强巴林寺不仅是康区最大的寺庙，而且还堪称康区文化艺术宝库。

 
　　 站在达马拉顶上，依山傍水的昌都尽收眼底。杂曲和昂曲之中，强巴林寺巍峨依附在横断山脉之之下，耸立在古冰河切割而成的红壤层上。由于昌都处在疏通川藏门户，商业活动成为这一带人民的主要职业，因而也影响到“神圣”的寺庙上来，故僧人们除了念经诵佛外，还兼营经商生息。昌都寺经商所得利息，平均分给众僧人，采取散发本酥油、糌粑、茶叶等生活必需品的办法支付。年终寺庙进行结算，如有盈利，便在新年时节，不分在小，平均分摊。昌都寺内的壁画、雕塑、建筑、经卷等艺术珍品和文物，与西藏其他地方的寺庙大同小异。 当然，作为旧西藏三大领主之一的寺庙，它占有大量土地，也免不了剥削农奴。不然，那些“赤巴”、“堪布”、“活佛”便无法维持奢侈的生活了。 别的不讲，就拿吃水果来说，寺庙高僧筑于加惹坝上，吃水得下到数百尺的河里去背。
        这个寺高有二十二口装水的大铜锅，每口锅得装一百多桶水。每天，二千五百僧人饮用的水，便得靠寺庙周围的百姓来支差背负了。陡峻的河堤，使多少人累死、饿死、失足落水淹死在河里！昌都寺号称“美丽花园”，但是，生活在这花园里的人民，却世世代代免不了爬崎岖的陡坡，下到河里去背水吃。冬天，河中水位低下，上游漂来死畜和垃圾；夏天，山洪爆发，“救苦救难”的菩萨并没能给众生带来甘泉，倒是解放后，党和人民政府在昌都寺旁建立自来水站，才解决了昌都僧俗人民吃水难的大问题。