佑民寺坐落于市内八一公园北面，东湖东岸，始建于南朝梁天监年间（502－519年），原为豫章王蔚综之师葛鱼单捐献的住宅。初名上兰寺，又因宅傍一井时闹蛟患，后建一大佛镇之，故太清初（547年）改称大佛寺。

    唐开元年间，改称开元寺。大历4年（769年），禅宗高僧马祖道一行来寺说法，四方信徒云集洪洲，入室弟子139人，使开元寺成为江南佛学中心。

    此后该寺时毁时修，先后易称过承天寺、能仁寺、永宁寺。相传明初朱元璋曾微服访此寺，被寺僧再三询问姓名而恼火，动怒在殿壁上题诗一首：“余尽江西数万兵，腰间宝剑摁留腥；野僧不识山河主，只管叨叨问姓名”。题毕掷笔而去，扬言要对寺僧严加问罪。僧人甚惧，恰逢一云游僧宿此，即将原诗清掉，另题一首：御笔题诗不敢留，留时惟恐鬼神愁；好将江水频频洗，犹有毫光射斗牛。朱元璋正准备对寺僧问罪时，得知壁上新诗，怒气顿消，不但未再追究，反赞“寺内大有人在”。

    清朝顺治年间，改名佑民寺。嘉庆年间，在后殿铸铜接引佛一尊，高1．6丈，重3万6千斤，南昌民谚“南昌穷是穷，还有三万六千斤铜”即指此。1929年，寺易称“佑民寺”。“文革”初期，寺及铜佛遭毁。1986年9月以来，逐步重建，至1991年初，山门、天王殿、大雄宝殿、药师殿、钟楼相继竣工，延僧开放，香火颇盛。号称南昌“三宝”（佑民寺铜佛、钟楼铜钟、普贤寺铁象）中幸存的铜钟（南唐铸，重10064斤）现置于钟楼内。

    新中国成立后，佑民寺得到应有的保护。1952年，原南海行宫、圆通寺处僧人迁住佑民寺，释心道应请出任住持。1956年，南昌市佛教协会在佑民寺成立，释心道当选为会长。1957年7月1日，省人民政府宣布佑民寺为第一批省级重点文物保护单位。1960年，全国人大常务委员会副委员长班禅额尔德尼·却吉坚赞在中共中央统战部长李维汉、江西省人民政府副省长潘震亚等人陪同下，来到佑民寺视察，受到释心道率僧众热情接待。

    1966年6月，“文化大革命”开始后，佑民寺惨遭破坏，殿堂建筑及诸殿佛、菩萨像和法器等毁坏殆尽，僧人被驱出山门，3万斤大铜佛像遭锯毁，除头部外，悉被熔化。寺宇院落全遭其他单位与个人占有。

    “文化大革命”结束后，1986年中共南昌市委和市人民政府作出修复佑民寺决定，拨出专款将寺内占用单位与住户迁出。次年春，钟楼和药师佛殿修复告竣。4月，省佛协常务理事释戒全应请入住，出任住持。寺内中断20多年的香火得以复燃。接着，省佛协副秘书长兼常务理事释达定应请为监院。得海内外四众弟子相助，特别是香港宝莲寺方丈释圣一多次捐款，佑民寺修复工程进展很快。1991年元月2日(农历11月2日)，佑民寺隆重举行大钟大鼓开响仪式，中断20余年的钟鼓得以复响。与此同时，南昌市佛教协会在佑民寺恢复活动，释戒全当选为会长。到1992年底，佑民寺山门、天王殿、大雄宝殿等修复重建工程基本完成，法堂、接引佛殿等建筑工程仍在进行之中。