人们看到的显应宫，是根据古建筑专家规划设计重建的，分地面新宫和地下古宫两个部分。第一期工程建筑面积为5600平方米，保留原遗址旧标高，作为地下宫，原有神像、柱础、神龛等按旧定位保护，以供研究和观赏。地面部分总平面布局以中轴线左右对称，采用传统的庭院殿堂形式。前立照壁，依次建有牌坊、山门、将军殿、天妃殿、大王殿，天井左右为钟鼓楼，后院两边角楼相峙，两翼配殿附龙，回廊绕院，主次分明，格局有序，气魄宏伟。第二期工程建筑面积1万平方米，建有花圃、停车场及综合楼等，目前正按规划设计施工中。     从阁楼式的通口顺阶而下，便可进入地下古宫观瞻。出土的古宫仅见两殿。前后殿的门墙均保存完好。记载重修的石碑出土时是在前殿门墙的左边。进入前殿大门，左边为妈祖神龛，右边为巡海大帝神龛。后殿正厅祀当地守境大王神祗，左偏殿为 医药神祗，右偏殿为临水夫人，各尊神像及其基座均保留原位不动 。